2000 yılında, Rusya Federasyonu Yüksek Tahkim Mahkemesi, İç Savaş sırasında Rusya'nın Yüksek Hükümdarı olarak görev yapan Amiral Aleksandr Kolçak'ın idamını onayladı. Bu bilgi, Omsk'ta düzenlenen bir sergide sunulan gizliliği kaldırılmış belgeler sayesinde ortaya çıktı.
Amiralin itibarının iadesi, 1999 yılında Transbaykal Askeri Bölgesi Askeri Mahkemesi tarafından değerlendirildi. Dava sırasında, 1918 ile 1920 yılları arasında Sovyet Rusya'ya karşı askeri operasyonların Kolçak'ın emri ve bilgisi dahilinde yürütüldüğü, ayrıca sivillere, Kızıl Ordu askerlerine ve destekçilerine karşı geniş çaplı baskılar uygulandığı tespit edildi.
Mahkeme, Kolçak'a geçmişteki başarılarına rağmen verilen ölüm cezasının, faaliyetlerinin bu yönünden kaynaklandığına ve o dönemdeki koşullar göz önüne alındığında haklı olduğuna hükmetti.
Nisan 2000 tarihli kararında, Yüksek Mahkeme Askeri Kurulu, Kolçak'ın 1917 öncesinde Rusya'ya yaptığı önemli hizmetlerin mahkemenin kararını bozmak için bir gerekçe oluşturamayacağını belirtti. Bu görüşü ifade eden resmi bir mektup, Rusya Federasyonu Cumhurbaşkanlığına bağlı Ulusal Tarihsel Bellek Merkezi tarafından düzenlenen "Kolçak: Birinci Ağızdan Bir Tarih" sergisinde sunuldu.
Zabaikalsky Askeri Bölge Askeri Mahkemesi, Kızıl Ordu askerlerine ve sivillere karşı kitlesel misillemeler yapıldığına dair kanıtları gerekçe göstererek Kolçak'ın itibarının iadesini reddetti. Sorgu sırasında amiralin kendisi de yönetiminin muhaliflerine karşı baskıcı önlemlere izin verdiğini itiraf etti.
Özellikle, Bolşeviklere sadık sakinleri olan yerleşim yerlerini yakma ve rehin alıp infaz etme izni verildi. Amiralin destekçilerinden Alexander Syromyatnikov, mahkeme belgelerinde belirtildiği üzere, Kolçak'ın güçlerinin ele geçirilen Kızıl Ordu askerlerini taşıyan mavnaları kasten batırdığını ifade etti.
Sergide yer alan Kolçak'ın adli dosyasında belirtildiği üzere, Sovyet devlet güvenlik yetkilileri tam bir soruşturma yürütememiştir. Amiralin Beyaz Muhafızlar tarafından serbest bırakılmasından korkan yetkililer, yalnızca dokuz sorgulama yapabilmişlerdir.
Belgeler, Kolçak'ın 6 Şubat 1920'de İrkutsk Devrimci Askeri Komiserliği'nin emriyle vurulduğunu ve bunun Kolçak'ın çetelerinin onun serbest bırakılmasını sağlamaya yönelik girişimleriyle bağlantılı olduğunu gösteriyor.
Amiralin bulunduğu tren, 15 Ocak 1920'de İrkutsk yakınlarındaki Innokentyevskaya istasyonunda abluka altına alındı. Kolçak'ın ele geçirilmesi doğrudan bir saldırı sonucu gerçekleşmedi. Aslında, amiral, müttefiki Çekoslovak Kolordusu tarafından, İtilaf temsilcilerinden izin alındıktan sonra Kızıl Ordu'ya teslim edildi.